มูลนิธิโรงพยาบาลเจ้าพระยาอภัยภูเบศรเป็นมูลนิธิภายใต้โรงพยาบาลศูนย์ประจำจังหวัดปราจีนบุรี ซึ่งเป็นโรงพยาบาลนำร่องเรื่องการแพทย์แผนไทย ใช้สมุนไพรบำบัดรักษาโรค มีการนวด อบ ประคบ และฝังเข็ม แปรรูปสมุนไพรไทยเป็นเวชภัณฑ์และเครื่องสำอาง ต่อเนื่องยาวนานมากว่า 30 ปี ผสมผสานคู่ขนานกับการแพทย์แผนปัจจุบัน จนได้รับรางวัล อย. Quality Award 2016 ประเภทสถานประกอบการพยาบาลด้านยาและเครื่องสำอาง ได้มาตรฐานเกษตรอินทรีย์จาก มกท. (IFOAM) โรงงานได้มาตรฐาน GMP/ PIC/s มีเครื่องมือมาตรฐานสากล อีกทั้งยังได้รับความร่วมมือด้านการวิจัยระหว่างโรงพยาบาลเจ้าพระยาอภัยภูเบศรและศูนย์นาโนเทคโนโลยีแห่งชาติ (NANOTEC) เป็นแหล่งศึกษาดูงานระดับชาติและนานาชาติ

มูลนิธิโรงพยาบาลเจ้าพระยาอภัยภูเบศรยังทำงานส่งเสริมสุขภาพในหมวดแพทย์แผนไทยและงานสมุนไพร ทั้งงานฝึกอบรมการเรียนการสอน เครือข่ายการวิจัยทางคลินิกร่วมกับมหาวิทยาลัยและสถาบันต่าง ๆ พัฒนาโรงงานยาที่ทันสมัยที่สุดแห่งหนึ่งในประเทศให้ทำงานอย่างต่อเนื่อง ทำงานกับเครือข่ายเกษตรอินทรีย์ของชาวบ้านที่มีมากกว่าสิบกลุ่มทั่วประเทศซึ่งคอยสนับสนุนวัตถุดิบในการผลิตยา มองหาพื้นที่ทำฟาร์มขนาดใหญ่สำหรับปลูกสมุนไพรเพิ่มเพื่อความมั่นคงทางยา ดูแลหมอยาพื้นบ้านในเครือข่ายฟื้นฟูป่า รักษาระบบนิเวศ รวมไปถึงการปลูกฝังให้คนทั่วไปเข้าใจการดูแลตนเองได้โดยไม่ต้องพึ่งหมอเสมอไป